Třetí a závěrečný díl trilogie Neandrtálská odchylka vrhá Mary Vaughanovou zpět do neandertálského světa, kde čelí zásadním osobním rozhodnutím. Musí se rozhodnout, zda přijme rozvod a s ním spojené vyloučení z katolické církve, smíří se s omezeným kontaktem s Ponterem – pouhými čtyřmi dny v měsíci – a zda je připravena na život v partnerství s jinou ženou. Navíc se potýká s otázkami týkajícími se budoucího dítěte s Ponterem: jaké bude jeho genetické složení – barast nebo gliksin – a zda zdědí „boží orgán“, tedy schopnost prožívat náboženské zážitky.