Čtyři měsíce po záhadném zmizení Tóruovy manželky Kumiko se životní situace hrdiny druhého dílu Kroniky ptáčka na klíčik stále neuklidňuje. Kumiko jednoho rána odešla do práce a už se nevrátila. Ačkoliv se zdá, že ho opustila kvůli jinému muži, Tóru se s takovým koncem jejich zdánlivě idylického vztahu nedokáže smířit. V zoufalství ho začne inspirovat opakující se motiv studny. Aby si v klidu promyslel, co se stalo, sestoupí do suché studny v zahradě opuštěného domu. V tomto okamžiku se jeho svět obrátí naruby a události se začnou řítit zběsilým tempem.