Kaoru Futami, mimořádně nadaný a zrale uvažující mladík, vyrůstá v Tokiu s otcem Hidejukim, vědcem zabývajícím se umělým životem, a matkou Mačiko, odbornicí na severoamerickou indiánskou kulturu. Když je Hidejukimu diagnostikována nevyléčitelná nemoc způsobená neznámým virem, Kaoru se rozhodne studovat medicínu a pokusit se otce zachránit. Jeho snahu o nalezení léku posiluje i láska k Reiko Sugiurové, která toutéž nemocí trpí. Čím dál více se ukazuje, že původ viru, který začíná ohrožovat veškerý život na Zemi, souvisí s projektem zvaným Smyčka, na kterém se jeho otec kdysi podílel. Smrtelný virus, měnící živé bytosti k obrazu své vlastní nesmrtelnosti, se zdá být zrozen ve světě virtuální reality vytvořeném právě ve Smyčce. Klíč k propojení obou světů by mohl mít Rjúdži Takajama, jeden z obyvatel Smyčky. Ve třetí části série se do tohoto příběhu vplétá temná pomsta Sadako Jamamurové, načrtává se v ní budoucnost zkázy jak ve virtuálním, tak ve skutečném světě, a zároveň se nabízí možnost záchrany lidstva. V této naději se kruh možná uzavře jednou provždy.