Muž bez vzpomínek se objeví jako ozvěna minulosti. Jason Bourne tentokrát nehledá sám sebe, ale zachraňuje jiného – muže vytaženého z ledové vody, těžce zraněného střelbou. Po zotavení se zjistí, že si na nic nepamatuje, ani na svou vlastní identitu. Tato situace v Bourneovi probudí bolestivé vzpomínky na vlastní ztracenou paměť. Zatímco se snaží odhalit identitu neznámého, elitní agentka izraelské rozvědky Rebeka ho neúnavně pronásleduje. Je posedlá jeho dopadením natolik, že se vzepřela rozkazům a Mosad vyslal proti ní svého nejlepšího vraha. Bourne riskuje vše, aby zjistil, proč Rebeka tolik riskuje. Postupně odhaluje rozsáhlé celosvětové spiknutí, ve kterém hraje klíčovou roli právě muž, který ztratil paměť.