Druhá část příběhu o neviditelném se zaměřuje na kněze, který během války skrývá v katolickém penzionátu židovského chlapce jménem Josef. Josef s knězem diskutuje o víře a snaží se porozumět složitým otázkám, které mu zatím unikají. Zároveň však netuší, jaké tajemství kněz ukrývá v podzemní kryptě pod kostelem.